W dziale Archiwum zgromadzona jest kolekcja wybranych pism pozostawionych przez Mikołaja Kopernika bądź ich najstarszych kopii, jak również szesnastowieczne druki jego autorstwa – De revolutionibus oraz przekład Listów obyczajowych Teofilakta Symokatty.
Rękopisy Kopernika i najstarsze kopie jego nie zachowanych pism prezentowane są w postaci zdigitalizowanych fotokopii oraz – w większości przypadków – transkrypcji oryginału i przekładu. Poszczególne dokumenty opatrzono regestami bądź obszerniejszymi opisami, a także informacją o miejscu przechowywania oryginału.
Przy tworzeniu kolekcji korzystano z oryginałów udostępnionych przez instytucje je przechowujące bądź z faksymile opublikowanych w tomie IV Dzieł wszystkich Mikołaja Kopernika (Warszawa 1992).